Protein–RNA interactions for Protein: P02776

PF4, Platelet factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4P02776 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC36A1-201ENST00000243389 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC023590.1-203ENST00000449065 411 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 LRRC75A-AS1-214ENST00000487066 763 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC013391.2-201ENST00000559041 501 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC011447.3-205ENST00000592022 1268 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 DDX27-206ENST00000618172 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
PF4P02776 NUDCD3-202ENST00000355451 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 PHKG1-201ENST00000297373 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 PCDHGB1-201ENST00000523390 4590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 DCUN1D2-AS-201ENST00000414992 330 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 LINC00426-204ENST00000420219 1056 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
PF4P02776 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms