Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB2Q9Y5E7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms