Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMED7Q9Y3B3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TMED7Q9Y3B3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms