Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TNNQ9UQP3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNQ9UQP3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms