Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TNFSF18Q9UNG2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms