Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
MED23Q9ULK4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
MED23Q9ULK4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms