Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRDM4Q9UKN5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM4Q9UKN5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms