Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTNAP2Q9UHC6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTNAP2Q9UHC6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms