Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NKX1-2Q9UD57 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKX1-2Q9UD57 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms