Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VPS29Q9UBQ0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
VPS29Q9UBQ0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 283.3 ms