Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
RRBP1Q9P2E9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
RRBP1Q9P2E9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC33.8■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.78■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC33.77■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
RRBP1Q9P2E9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RRBP1Q9P2E9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 590.2 ms