Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RDH8Q9NYR8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RDH8Q9NYR8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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