Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RBM28Q9NW13 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RBM28Q9NW13 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RBM28Q9NW13 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms