Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPTLC3Q9NUV7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPTLC3Q9NUV7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms