Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SALL1Q9NSC2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SALL1Q9NSC2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SALL1Q9NSC2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms