Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SEMA4BQ9NPR2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SEMA4BQ9NPR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms