Protein–RNA interactions for Protein: Q9H173

SIL1, Nucleotide exchange factor SIL1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIL1Q9H173 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SIL1Q9H173 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SIL1Q9H173 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SIL1Q9H173 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SIL1Q9H173 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SIL1Q9H173 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SIL1Q9H173 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms