Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
ZNF541Q9H0D2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF541Q9H0D2 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms