Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FOXQ1Q9C009 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FOXQ1Q9C009 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
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