Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NUP58Q9BVL2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NUP58Q9BVL2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms