Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MXRA8Q9BRK3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MXRA8Q9BRK3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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