Protein–RNA interactions for Protein: Q99943

AGPAT1, 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPAT1Q99943 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AGPAT1Q99943 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AGPAT1Q99943 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AGPAT1Q99943 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms