Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC43Q96MW1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC43Q96MW1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms