Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN5

TCEANC2, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEANC2Q96MN5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEANC2Q96MN5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEANC2Q96MN5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms