Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGAP3Q96FM1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAP3Q96FM1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAP3Q96FM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms