Protein–RNA interactions for Protein: Q96CW5

TUBGCP3, Gamma-tubulin complex component 3, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP3Q96CW5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TUBGCP3Q96CW5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TUBGCP3Q96CW5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms