Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL2

SPIRE2, Protein spire homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE2Q8WWL2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPIRE2Q8WWL2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPIRE2Q8WWL2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPIRE2Q8WWL2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms