Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PROKR1Q8TCW9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PROKR1Q8TCW9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms