Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NEDD1Q8NHV4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NEDD1Q8NHV4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NEDD1Q8NHV4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms