Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATL2Q8NHH9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATL2Q8NHH9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATL2Q8NHH9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms