Protein–RNA interactions for Protein: Q86VP3

PACS2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2Q86VP3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PACS2Q86VP3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PACS2Q86VP3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms