Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTF1AQ7RTS3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PTF1AQ7RTS3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTF1AQ7RTS3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms