Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8S5

OTUD6A, OTU domain-containing protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6AQ7L8S5 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
OTUD6AQ7L8S5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
OTUD6AQ7L8S5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
OTUD6AQ7L8S5 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms