Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1I2

SV2B, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2BQ7L1I2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SV2BQ7L1I2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SV2BQ7L1I2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.8 ms