Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
USP50Q70EL3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
USP50Q70EL3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
USP50Q70EL3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms