Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C16orf54Q6UWD8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C16orf54Q6UWD8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms