Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FBXO38Q6PIJ6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO38Q6PIJ6 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms