Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LARP1BQ659C4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LARP1BQ659C4 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LARP1BQ659C4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms