Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
GARNL3Q5VVW2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GARNL3Q5VVW2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms