Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LRRC38Q5VT99 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRC38Q5VT99 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRC38Q5VT99 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms