Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5X7

BEND3, BEN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND3Q5T5X7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BEND3Q5T5X7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BEND3Q5T5X7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BEND3Q5T5X7 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms