Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RTL5Q5HYW3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
RTL5Q5HYW3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
RTL5Q5HYW3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms