Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH77

XKR3, XK-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR3Q5GH77 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
XKR3Q5GH77 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
XKR3Q5GH77 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
XKR3Q5GH77 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms