Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC96Q2M329 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC96Q2M329 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCDC96Q2M329 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms