Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TNXAQ16473 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TNXAQ16473 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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