Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GABRA6Q16445 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
GABRA6Q16445 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
GABRA6Q16445 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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