Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TRIP10Q15642 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
TRIP10Q15642 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP10Q15642 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP10Q15642 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP10Q15642 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP10Q15642 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
TRIP10Q15642 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
TRIP10Q15642 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms