Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RYR3Q15413 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RYR3Q15413 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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