Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD1Q15327 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD1Q15327 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ANKRD1Q15327 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ANKRD1Q15327 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ANKRD1Q15327 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ANKRD1Q15327 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ANKRD1Q15327 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD1Q15327 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms