Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX17Q15036 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX17Q15036 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX17Q15036 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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